處理量將決定您的高壓滅菌器是否適合每天必須滅菌的高壓滅菌介質。為了確定高壓滅菌器的通過量，必須確定每個周期可以滅菌的高壓滅菌介質的數量（以及準備，裝載和卸載介質所需的時間）。zui好的高壓滅菌器應是其通量與實驗室每天和每個周期所需的zui大通量相匹配的高壓釜。

盡管循環時間取決于高壓滅菌介質的滅菌要求，但高壓釜的預熱時間和冷卻時間卻截然不同，這可能會增加整個循環時間。某些功能（例如冷卻風扇）可以大大加快此過程，在某些情況下，一天中可以進行更多的循環，并可以提高吞吐量。

您選擇的高壓滅菌器類型還可以極大地提高操作效率，并且必須考慮負載的頻率，負載大小以及使用高壓滅菌器的人數。需要多個且穩定的吞吐量的操作可以從擁有多個中型高壓滅菌器中受益匪淺，而這些中型高壓滅菌器的使用可能會錯開，而大型高壓滅菌器會使人們等待，并給操作帶來巨大的負擔。在發生故障的情況下，擁有幾個較小的高壓滅菌器也是理想的選擇，因為可以使用許多備用高壓滅菌器，而不是將操作完全關閉。